控制水分，低温储存 在储存过程中遭受高温、高湿是导致饲料发生霉变的主要原因。因为高温、高湿不仅可以激发脂肪酶、淀粉酶、蛋白酶等水解酶的活性，加快饲料中营养成分的分解速度，而且还能促进微生物、储粮害虫等有害生物的繁殖和生长，产生大量的湿热，导致饲料发热霉变。因此，储存饲料时要求空气的相对湿度在70%以下，饲料的水分含量不应超过12.5%。
防霉除菌，避免变质 饲料在储存、运输、销售和使用过程中极易发生霉变。大量的霉菌不仅消耗、分解饲料中的营养物质，使饲料质量下降、报酬降低，而且还会引起采食这种饲料的畜禽发生腹泻、肠炎等，严重的可致其死亡。实践证明，除了改善储存环境之处，延长饲料保质期的更有效的方法就是采取物理或化学的手段防霉除菌，如在饲料中添加脱霉剂等。
总之，应该将配合饲料存放在低温、干燥、避光和清洁的地方。一般情况下，颗粒状配合饲料的储存期为1~3个月；粉状配合饲料的储存期不宜超过10天；粉状浓缩饲料和预混合饲料因加入了适量的抗氧化剂，其储存期分别为3~4周和3~6个月。